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人工智能程序預(yù)測(cè)出98.5%的人類蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)

2021年08月02日來源:光明日?qǐng)?bào)

英國(guó)“深度思維”公司研究人員領(lǐng)銜的團(tuán)隊(duì)日前在英國(guó)《自然》雜志發(fā)表報(bào)告說,該公司的人工智能程序“阿爾法折疊”(AlphaFold)預(yù)測(cè)出98.5%的人類蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),有助于深入理解一些關(guān)鍵生物學(xué)信息,從而更好地開展藥物研發(fā)。

人類蛋白質(zhì)組是指人類基因組編碼所有蛋白質(zhì)的集合,考慮到理解人類蛋白質(zhì)組對(duì)健康和醫(yī)藥的重要性,研究人員一直以來付出大量努力來確定其中的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),但用普通實(shí)驗(yàn)方法預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)十分耗時(shí)。人類基因組中目前只有三分之一的蛋白質(zhì)3D結(jié)構(gòu)已通過實(shí)驗(yàn)確定。

“阿爾法折疊”是“深度思維”公司開發(fā)的一款人工智能程序,可用于預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)。該公司研究人員利用“阿爾法折疊”確定了覆蓋幾乎整個(gè)人類蛋白質(zhì)組(98.5%的所有人類蛋白質(zhì))的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),并將這些結(jié)構(gòu)放入公開的數(shù)據(jù)庫(kù)免費(fèi)供全球科研人員使用。

氨基酸是連接起來形成蛋白質(zhì)的亞單位。研究人員還讓“阿爾法折疊”對(duì)人類蛋白質(zhì)組58%的氨基酸結(jié)構(gòu)位置給出可信預(yù)測(cè);其中對(duì)35.7%的結(jié)構(gòu)位置預(yù)測(cè)達(dá)到很高可信度。

報(bào)告作者之一、“深度思維”公司聯(lián)合創(chuàng)始人德米斯·哈薩比斯在一篇文章中說,了解一部機(jī)器的結(jié)構(gòu)之后才能清楚知道它能做什么,因此深入分析蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)有助于我們理解它的功能。研究人員在尋找疾病治療方案以及應(yīng)對(duì)包括抗生素耐藥性、微塑料污染和氣候變化等人類社會(huì)面臨的重大挑戰(zhàn)過程中,也能從中受益。據(jù)新華社


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